Elin Sørhus

Utdannelse:

2013-2015. UiO, PhD i molekylærbiologi og økotoksikologi.

I doktorgraden: "Crude oil and its high toxic effect on early life stages of Atlantic haddock -  to the heart of the problem" så jeg på effekten av oljeforurensing på tidlige livsstadier av hyse. Effektene ble studert ved å fenotypisk bestemme abnormaliteter, samt å se på avvik i genuttrykk i de eksponerte gruppene ved bruk av ulike molekylærbiologske metoder. Ved å se genuttrykk og fenotype i sammenheng, foreslår jeg i oppgaven de molekylære mekanismene bak ulike deformiteter, som underutviklet hjerte, observert i hyse.

2002-2005. UiB, Master i molekylærbiologi

I master oppgave: "Studies on minispectrins: Expression in E. coli, purification and in vitro interaction studies" studerte jeg en miniversjon av spektrin, også kalt minispektrin. Jeg lagde en modifisert utgave a proteinet, uten en spesifikk N-terminal hale. Dette ble gjort for å strukturelle og funksjonelle egenskaper til de to versjonene av minispektrin. Kloning, transformering av E.coli celler, uttrykk av protein i E. coli , protein rensing, analyse av makromolekylære interaksjoner var metoder som ble brukt i masterstudiet.

1999-2002. HiB, avd. ingeniør. Bioingeniørutdanning

Arbeidserfaring:

2013- 2015. CEES-UiO/VISTA/IMR. Doktorgradsstipendiat (arbeidssted Bergen)

2005-2012. Overingeniør ved Havforskningsinstituttet i Bergen (IMR)

2005. Avdelingsingeniør ved Høyteknologisenteret i Bergen

1999-2004. Sommerjobb som bioingenør/bioingeniør assistent

I doktorgradssprosjektet "Assessment of the long-term effects of oil exposure on early life stages of haddock using transcriptomics and fitness observations" har jeg arbeidet med embryo og larve av Atlanterhavshyse. I prosjektet har jeg utført innsamling av materiale, bilde- og videotakning av embryo og larver, bilde- og videoanalyse, utført molekylærbiologiske metoder for å studere genuttrykk, deriblant Real time RT PCR, in situ hybridisering og har analysert transkriptomdata.

På havforskningsinstiuttet har jeg jobbet i to forskningsgrupper, Reproduksjon og vekst og Helse gruppen. I mitt arbeid i Reproduksjon og vekst har jeg detektert genuttrykk av ulike hormoner og reseptorer involvert i sex differensiering og modning i laks og torsk. I helsegruppen var jeg involvert i studier angående NODA infeksjon på torsk og kveite, og studier på karakterisering av immunssytem i kveite.

Metoder brukt i mitt arbeid ved IMR har vært RNA isolering, protein og RNA isoleringssystem, cDNA syntese etterfult av PCR eller RT-RTPCR, sekvensering, western blotting, immun histokjemi, in situ hybridisering og noe microarray. Har også vært invovlert i sampling og disseksjon av fisk.

På høyteknologisenteret fortsatte jeg arbeidet på minispektrin-studiet